1945 - 1949
Flytrafikken voksede hurtigt i Frankrig efter Anden Verdenskrig. Sikker lufttransport krævede personale, der var uddannet specielt til denne aktivitet. Det krævede også, at folk i forskellige sektorer inden for luftfartsverdenen arbejdede sammen og forstod hinanden. Det var derfor, ENAC blev oprettet. Max Hymans, generalsekretæren for civil og kommerciel luftfart, var hovedorganisator.
1949 - 1955
ENAC blev oprettet den 28. august 1949 (dekret 49-1205) i Paris. Universitetet blev placeret i Orly syd for Paris. René Lemaire betragter ENAC som "et universitet for luftfartssikkerhed". Denne prioritering af sikkerhed er naturlig for ENAC, da den er den første grund til at uddanne fremtidige teknikere og fremtidige flyvere på et enkelt universitet.
I en rapport fra Inspection générale de l'aviation civile hedder det: "Universitetets ophavsmænd havde til hensigt at udvikle et fællesskab mellem besætningen og jordpersonalet, et fællesskab af idéer, gensidig viden og agtelse, som er afgørende for det teamwork, der er nødvendigt for lufttransporten." Uddannelseskurserne var længere eller kortere afhængigt af specialitet.
1955 - 1959
Dekretet af 13. oktober 1959 bekendtgør universitetets første partner: Air France. Det resulterer i en fordeling af opgaverne og etablerer en rekruttering af flypilotelever uden tidligere flyveerfaring. På forsøgsbasis tog universitetet i 1958 imod de første flypilotstuderende på forsøgsbasis.
I mellemtiden udviklede ENAC et samarbejde med École nationale de la météorologie og fremmede uddannelsen i dette fag for flyveledere. Efter Anden Verdenskrig hjalp ENAC med at omstille det militære flyvepersonale. Service de l'aviation légère et sportive (SALS) tilbød i henhold til dekretet af 31. marts 1951 gratis flyveuddannelse til flypilotkandidater, der kom fra hæren.
Fra 1949 til 1959 steg antallet af kurser fra 6 til 64 og antallet af elever fra 49 til 800. I 1956 blev navigationsinstruktørklassen oprettet med åbningen af den tilsvarende uddannelse. Nogle gange er et kursus simpelthen oprettet for at opfylde et behov. I 1958 startede kurset for teoretisk uddannelse af flypiloter i 1958.
Livet på ENAC Orly er derefter præget af den årlige udflugt for alle eleverne, som uden tvivl er et af studiernes højdepunkter. Den har sin del af uventede, men også sine ritualer, som f.eks. den modtagelse i fuld uniform af universitetets embedsmænd og de studerende af de lokale myndigheder ved ankomsten til et nyt sted.
1959 - 1968
Universitetet flyttede til Toulouse i 1968, hvor det nu ligger hovedcampus. Det blev også ændret fra at være en ekstern afdeling af den franske civile luftfartsmyndighed til en offentlig forvaltningsinstitution i 1970.
Det franske civilluftfartsuniversitet blev oprettet i nærheden af Paris-Orly Lufthavn. Denne beliggenhed nær den største franske lufthavn gør det nemt at bruge fly til mange aktiviteter - navigationsflyvninger, reklamerejser, ... og nærheden til mange flyselskaber og flyproducenter eller med tilknytning til luftfartsindustrien, hvis ledere sandsynligvis vil blive indkaldt til foredrag, konferencer, ...
Trafikken i Paris-Orly lufthavn voksede imidlertid hurtigt. I midten af 1950'erne begyndte planlægningen af en ny placering i nærheden af de parisiske lufthavne. Decentralisering var et af motiverne. De potentielle placeringer er alle en del af en radius på 150 km omkring Paris, bl.a. Melun, Pontoise, Coulommiers, Étampes, Reims, Évreux, Chartres, Orleans osv. I en rapport af 20. maj 1959 opregnes ulemperne ved en placering for langt fra Paris. En analyse fra René Lemaire støttede i sin rapport af 14. juni 1960 en flytning til Toulouse. Toulouse 1 University Capitole er et af de ældste universiteter i verden. École nationale supérieure d'ingénieurs de constructions aéronautiques havde siden 1961 haft til huse i Toulouse, og École nationale supérieure de l'aéronautique et de l'espace ville flytte fra Paris til byen). Den 15. juni 1961 blev flytningen til Toulouse godkendt af premierminister Michel Debré. Den blev bekræftet af hans efterfølger Georges Pompidou i et brev af 23. juli 1963.
I april 1966 begyndte man at opføre nye bygninger på Rangueil campus. Projektet sluttede den 19. august 1968, da personalet blev inviteret. Det akademiske år begyndte den 16. september 1968. Der forventes 500 studerende, heraf 325, der påbegynder deres uddannelse. Disse er som følger: 15 ingeniørstuderende i luftfartsteknik, som i vid udstrækning kommer fra École Polytechnique, 70 ingeniørstuderende i luftfartsteknik fra toårige studier efter den franske studentereksamen, 60 flypilotstuderende, 100 flyvelederstuderende, 40 elektronikstuderende, 20 erhvervspilotstuderende og 20 flyvelederstuderende.
1968 - 1975
Selv om den mente, at det var bedre ikke at træffe beslutning om ENAC's status, før universitetet åbnede dørene til sit nye campus, har den permanente kommission taget hensyn til problemet med en utilstrækkelig retlig status. Dette problem er gammelt: det blev identificeret kort efter oprettelsen af universitetet og er dukket op igen mange gange, som det fremgår af de inspektionsrapporter, der vedrører institutionens forvaltning. ENAC følges nøje af sin tilsynsmyndighed. Inspektionsrapporterne udkommer med en hurtig kadence, i gennemsnit et hvert andet år, nogle gange mere. Den dom, der fokuserer på institutionens forvaltning, er undertiden streng. I de samme rapporter, i midten af 1950'erne, bestrides universitetets eksistens, hvilket ikke var tilfældet i de foregående år. Som eksempel kan nævnes Brancourt Controller's rapport (fortrolig) af 12. marts 1952, baseret på ENAC's organisation og drift. Vi lærer, at universitetet har "en mangel på doktrin", at "der er en vis spænding med Air France's uddannelsescenter", og endda at "ENAC er vanvittigt".
I virkeligheden kan svaghederne i vid udstrækning forklares med de vanskeligheder, der skyldes, at ENAC's status ikke er i overensstemmelse med arten af dets aktiviteter, som kræver, at det skal tilbyde kurser til studerende og praktikanter, der ikke alle er tjenestemænd fra dets tilsynsmyndighed, eller at det skal anvende undervisere af meget forskellig oprindelse. Den tunge proces for tildeling af universiteternes budget er i vanskeligheder, så snart andre typer indtægter reduceres, f.eks. ikke-offentlige ressourcer. Dette sker i højere grad i årene 1958-1964. I 1962 overvejer ENAC's ledelse at forhøje undervisningsafgifterne, kursuspriserne og gebyrerne for kunder uden for den franske civile luftfartsmyndighed. Institutionens status gør imidlertid de nødvendige prisjusteringer til genstand for en så vanskelig godkendelsesproces, at den til sidst blokeres. Derfor forekommer en anden type status, "offentlig administrativ institution", meget mere hensigtsmæssig. Den endelige beslutning er truffet ved dekret nr. 70-347 af 13. april 1970, med virkning fra 1. januar 1971. Som offentlig administrativ institution har ENAC en bestyrelse. René Lemaire er den første formand.
1975 - 1990
Fra 1975 begynder noget nyt. Den består i en stigning i andelen af ingeniørstuderende, der kaldes "civile", i modsætning til ingeniørstuderende, der er "tjenestemænd" (embedsmænd). ENAC er ved at blive en vigtig aktør inden for uddannelse til luftfartsindustrien (civilt personale), mens dets primære mål kun var at uddanne tjenestemænd til Direction générale de l'aviation civile. Det er rigtigt, at det ikke er nyt, at der findes studerende til den private sektor på universitetet: det var i 1956, at de første af dem blev uddannet. I slutningen af 1950'erne berører denne ansættelse imidlertid kun et mindretal af de studerende. Det sker primært for at kompensere for den ulempe, som består i det meget forskellige antal studerende, der skal arbejde i administrationen, og for at forhindre, at der er for store forskelle i størrelsen af de successive forfremmelser. Denne anden kilde har imidlertid en tendens til at blive vigtigere og vigtigere for til sidst at blive den første. Dette resulterer i en revision af undervisningen. ENAC's ingeniøruddannelse, især den af specialet kaldet "faciliteter" - den fokuserer på elektronik - forfører de industrielle sektorer for elektronik og informationsteknologi. Uden at have særligt ønsket det, har universitetet efterhånden rollen som et nationalt ingeniøruniversitet.
Industri orienteret universitet, forskning optrådte i 1984, efter loven om videregående uddannelse, der fastsætter, at "ingeniøruddannelse [...] har en forskningsaktivitet, grundlæggende eller anvendt, " og er organiseret omkring fire områder: elektronik, automatisering, computer og lufttransport økonomi. Universitetet føler derefter interesse for, at de kommende ingeniører lærer forskningsmetoder: mens den deduktive ræsonnementmetode, som længe blev foretrukket af lærerne i de toårige studier efter den franske studentereksamen og på universiteterne, viser sine begrænsninger, synes den induktive ræsonnementmetode, som er karakteristisk for forskning, gradvist at være bedre tilpasset til de funktioner, som ingeniørerne i dag udfører. Det seneste udtryk for ENAC's stigende interesse for forskning er oprettelsen af et laboratorium for økonomi inden for lufttransport, hvilket afspejler ønsket om ud over selve lufttransporten også at studere visse beslægtede aktiviteter som f.eks. luftfart.
I midten af 1980'erne opstod programmerne for specialiserede mastere. De er for de flestes vedkommende opstået på baggrund af en industriel efterspørgsel, herunder Groupement des industries françaises aéronautiques et spatiales, med henblik på at støtte eksportkontrakterne gennem uddannelse. Samtidig med at de opfylder behovene hos mange franske studerende eller fagfolk, kan de faktisk på relativt kort tid uddanne nogle udenlandske ledere. I samme periode er der sket en diversificering af universitetets efteruddannelse. Efteruddannelseskurserne er organiseret inden for fem hovedområder: flytrafiksystemer, elektronik, edb, luftfart og sprog/humanistiske fag.
1990 - i dag
Universitetets internationale dimension voksede i 1990'erne. Den er dog begrænset af udformningen og gennemførelsen af den nye uddannelse for flyveledere. Indsatsen krævede en specifikt europæisk komponent. Den består først i deltagelse i europæiske projekter som EATCHIP (European Air Traffic Control Harmonization and Integration Program) og dernæst i deltagelse i mobilitetsprogrammer for studerende som Erasmus eller Socrates. Under disse programmer tager universitetet imod et stigende antal udenlandske studerende. Dermed skaber det tætte forbindelser med udenlandske universiteter, herunder universiteterne i Berlin og Darmstadt i Tyskland samt Tampere i Finland. Siden 1990 har universitetet haft nye opgaver. ENAC forhandler således nye kontrakter om studier og forskning i udlandet. I 2000'erne oprettes der kurser, der udelukkende undervises på engelsk, og der udvikles aktiviteter med fokus på luftfart. I 2009 arrangerer universitetet og dets alumneforening den første udgave af salon du livre aéronautique (flylitterær festival) i Toulouse. I december 2010 bliver ENAC et ICAO-center for uddannelse i luftfartssikkerhed.
I mellemtiden udvikler universitetet nye undervisningsfaciliteter: flyvekontrolsimulatoren "CAUTRA", flyvepladskontrolsimulatoren "AERSIM", en Airbus A320-flystyringssystem-simulator, en statisk model af Airbus A321's motor og et laboratorium for telekommunikationsnetværk.
Siden den 1. januar 2011 og sammenlægningen af ENAC og SEFA er universitetet det største europæiske luftfartsuniversitet.
I 2013 starter ENAC sammen med DGAC konsulentfirmaet France Aviation Civile Services.
Historie af hoveder
Den nuværende leder af universitetet er Olivier Chansou, efter Marc Houalla, der var direktør for SEFA fra 2006 til den 1. januar 2011. Det er den ottende person, der har været direktør siden 1949. Han blev valgt den 27. november 2017. Direktørerne siden 1949 fremgår af følgende tabel.