Pandoravirus: hvad er det? Kæmpestor virus med unikt genom og 'fjerde domæne'
Pandoravirus: kæmpestor virus med verdens største genom, 93% unikke gener og debat om et muligt "fjerde domæne" — opdag oprindelse, struktur og ny forskning.
Pandoravirus er en slægt af usædvanligt store vira, først beskrevet i 2013. De inficerer, ligesom flere andre store vira, Pandoravirus amøber (for eksempel Acanthamoeba). Partiklerne er ovale og kan være op til omkring en mikrometer i længden, så de er synlige i et let mikroskop sammenlignet med de fleste andre vira.
Størrelse og genom
Genomerne hos Pandoravirus er blandt de største, der kendes hos vira. Kendte arter har genomstørrelser på omkring 1,9 til 2,5 millioner basepar DNA, hvilket gør dem større end genomet hos flere andre kendte "store" vira som Megavirus. Selvom partikelvolumen hos Pithovirus kan være større, indeholder Pandoravirus de største kendte virusgenomer (op til cirka 2,5 millioner basepar).
Genindhold og ukendte gener
En meget stor andel — omkring 90–93 % — af de gener, der identificeres i Pandoravirus-genomer, har ingen tydelige slægtskaber til gener i andre kendte organismer. Disse såkaldte ORFans (unikke åbne læserammer) gør det svært at forudsige funktioner for de fleste gener. Samtidig indeholder genomet også enkelte gener, som ligner gener fra celler (både bakterier, arkæer og eukaryoter), hvilket tyder på, at genudveksling mellem vira og celler kan have fundet sted gennem evolutionen.
Struktur og replikation
Pandoravirus-partikler er ualmindeligt store og ovale, og deres struktur adskiller sig fra de mere kugleformede eller icosahedrale kapsider, der ses hos mange andre vira. Selvom Pithovirus' kapsid kan være fysisk større, er det altså Pandoravirus, der indeholder det største kendte DNA-genom.
Infektion begynder typisk ved, at en amøbe optager partiklerne ved fagocytose. Virusgenomet frigives i cytoplasmaet og replikeres i såkaldte virale fabrikker, der dannes i værtscellen. Til sidst frigives nye partikler ofte ved opløsning (lysis) af den inficerede amøbe.
Betydning for klassifikation: "fjerde domæne"?
Det faktum, at så stor en del af Pandoravirus-generne ikke kan genkendes i andre organiserede livsformer, førte nogle forskere til at foreslå, at disse vira kunne repræsentere et "fjerde domæne" ud over de tre domæner for levende organismer — bakterier, arkæer og eukaryoter. Det er vigtigt at pointere, at Virus generelt ikke regnes som en del af disse tre domæner, og synspunkter om et selvstændigt domæne for store DNA-vira er omdiskuterede i fagmiljøet.
Mange forskere mener i dag, at den høje andel unikke gener hos Pandoravirus i højere grad kan forklares ved hurtig evolution, omfattende horisontal genoverførsel og begrænset prøveudtagning i sekventeringsdatabaser end ved en helt separat evolutionær oprindelse. Debatten illustrerer dog, hvordan opdagelser af usædvanlige store vira udfordrer vores forståelse af virusers og cellers evolutionære forhold.
Eventuel risiko og forskning
Der er ingen dokumentation for, at Pandoravirus udgør en risiko for mennesker eller højere dyr; kendte isolater er fundet i miljøprøver og i forbindelse med amøber. Forskningen i disse vira er vigtig for at forstå grundlæggende biologiske processer, virus–vært-interaktioner og for at belyse livets evolutionære historie.
Samlet set er Pandoravirus et eksempel på, hvor store og komplekse virus kan være, og deres genomer fortsætter med at give nye udfordringer og indsigt i virologi og evolutionær biologi.
Spørgsmål og svar
Q: Hvad er pandoravirus?
A: Pandoravirus er en slægt af meget store vira.
Q: Hvor stort er genomet i Pandoravirus?
A: Pandoravirus' genom er på 1,9 til 2,5 megabaser af DNA, hvilket er dobbelt så stort som Megavirus'.
Q: Hvilken type celler inficerer pandoravirus?
A: Pandoravirus inficerer amøber.
Q: Hvordan adskiller genomet i Pandoravirus sig fra andre store vira?
A: Pandoravirus' genom adskiller sig meget fra andre store vira i udseende og genomstruktur.
Q: Hvor stor en procentdel af Pandoravirus' gener kendes ikke fra andre mikrober?
A: Omkring 93 % af Pandoravirus-generne kendes ikke fra andre mikrober.
Q: Hvad er det foreslåede "fjerde domæne", som nogle forskere har foreslået, at Pandoravirus tilhører?
A: Det foreslåede "fjerde domæne", som nogle forskere har foreslået, at Pandoravirus tilhører, er ud over bakterier, arkæer og eukaryoter.
Q: Anses vira for at være inden for livets tre domæner?
A: Virus som helhed anses ikke for at være inden for livets tre domæner.
Søge