Første slag ved Kernstown
Slaget blev udkæmpet i Frederick County og Winchester i Virginia den 23. marts 1862. Det var det indledende slag i Jacksons Valley Campaign. Jacksons kavalerikommandant, oberst Turner Ashby, havde været i skænderi med Unionens tropper den 22. marts 1862. Den 23. marts sendte Jackson sit kavaleri under Ashby mod Unionens stilling. Oberst Nathan Kimball, Unionens øverstbefalende, koncentrerede sine styrker på Pritchard Hill og opstillede også sit artilleri der. Jackson opstillede sit artilleri vest for Pritchard Hill på Sandy Ridge. Under slaget besøgte han sin artilleristandpunkt. Han opdagede, at mens han troede, at han angreb en moderat stor unionshær, kæmpede han i virkeligheden mod en hel division. Da han så en styrke, der var meget større end hans, vendte Jackson sig til sin assistent og sagde: "Vi er på vej ind i det."
Jackson ændrede sin angrebsplan. Han placerede sit infanteri omkring sine kanoner på Sandy Ridge. Kimball, der ikke var klar over, at hans styrker var flere end Jacksons, angreb Sandy Ridge for at bringe de konfødererede kanoner til tavshed. Omkring klokken fire løb Kimballs infanteri ind i Jacksons Stonewall Brigade ved foden af Sandy Ridge med hårde kampe. Jackson formåede kun at holde sin stilling, selvom han blev ved med at sende flere tropper. Kampen udviklede sig snart til et dødvande, hvor ingen af siderne var i stand til at presse den anden tilbage. Kimball begyndte at sende forstærkninger fra Unionen, og klokken seks var de konfødererede ved at løbe tør for ammunition. På dette tidspunkt begyndte de at trække sig tilbage. Snart blev tilbagetrækningen til en løbende kamp, som først sluttede efter mørkets frembrud.
Selv om slaget var et taktisk nederlag for konføderationen, var det en strategisk sejr for sydstaterne. Det forhindrede Unionen i at sende styrker fra Shenandoah-dalen for at forstærke McClellan på halvøen.
Slaget ved McDowell
Efter slaget ved Kernstown trak Jackson sig tilbage sydpå til Swift Run Gap. Hans hær sluttede sig til Edward Johnsons hær i det nordvestlige område. De fik også selskab af en division under Richard S. Ewell. Jackson havde nu omkring 17.000 konfødererede soldater.
Johnsons hær i det nordvestlige område var på størrelse med en brigade. På det tidspunkt, hvor han sluttede sig til Jackson, blev hans hær fulgt af en unionsbrigade under kommando af general Robert H. Milroy. Milroy ventede støtte fra en anden unionsbrigade under general Robert C. Schenck. Milroy rykkede vestpå nær landsbyen McDowell, der ventede på Milroy. Jackson, der nu befandt sig i Staunton, Virginia, rykkede sine styrker vestpå mod Milroy og Scheneck's unionsbrigader. Den 8. maj angreb Milroy de konfødererede på Sitlington's Hill. I fire timer kæmpede de to hære, og til sidst kastede de Milroys hær tilbage ved mørkets frembrud. Mens de konfødererede led større tab, trak Milroy og Schenck sig tilbage ind i det vestlige Virginia i løbet af natten. Dette gav Jackson fri til at trænge til angreb på den anden unionshær i dalen. Han ville holde Unionens styrker beskæftiget i dalen i endnu en måned.
Slaget ved Front Royal
Det næste slag blev udkæmpet den 23. maj 1862 ved Front Royal i Virginia. Jacksons styrker angreb en 1.000 mand stor unionsgarnison under kommando af oberst Kenly. De konfødererede overraskede pjecerne og overrumplede dem hurtigt. De drev unionsstyrken tilbage gennem Front Royals gader til Camp Hill (nu Overlook Park i den sydøstlige del af Winchester). Kenlys styrke forsøgte at sætte ild til flodbroerne, mens de trak sig tilbage, men brandene blev hurtigt slukket. På Camp Hill holdt Unionens styrker stand, inden de faldt tilbage til Guard Hill. De blev hurtigt overhalet af de konfødererede styrker og trak sig tilbage mod Cedarville. Det konfødererede kavaleri under major Flournoy foretog to angreb på de tilbagetrækkende EU-styrker. Omkring 900 unionssoldater overgav sig.
Første slag ved Winchester
Jacksons sejr ved Front Royal fik Unionens general Nathaniel Banks til at flytte sine styrker fra Strasburg og trække sig tilbage til Winchester. Med Jackson nu på sin højre flanke var Banks i fare for at blive afskåret fra sin base i Winchester. Præsident Lincoln mente, at Jacksons hær i Shenandoah-dalen truede sikkerheden i Washington D.C. Han beordrede general Irvin McDowells korps til at holde deres stilling ved Fredericksburg i Virginia og ikke slutte sig til McClellans unionsfremstød mod Richmond.
Da Banks ankom til Winchester, begyndte han at organisere sit forsvar. Jacksons hær nærmede sig fra syd, mens Ewells hær nærmede sig fra sydøst. Den 25. maj foretog Jacksons styrker deres første angreb, men blev kastet tilbage. Ewells division angreb Camp Hill. Samtidig overrumplede Jacksons Louisiana Brigade udflankerede og overrumplede derefter Unionens stilling på Bower's Hill (den sydvestlige del af Winchester). Med deres flanker brudt begyndte unionstropperne et uorganiseret tilbagetog gennem byen Winchester. Selv borgerne i Winchester skød på unionssoldaterne. Banks trak sig tilbage over Potomac-floden tilbage til Maryland. Som følge af slaget mistede Banks omkring 2.000 mand og næsten alle sine forsyninger. De samlede konfødererede tabstal var kun på omkring 400. Dette var den afgørende sejr for Jacksons Valley Campaign.
Slaget ved Cross Keys
Lincoln var nu bekymret for, at hvis Banks ikke kunne holde Jackson, ville hans konfødererede hær måske gå til angreb på Washington D.C. Den 24. maj havde han givet generalerne John C. Frémont og Irvin McDowell ordre til at sende tropper til støtte for Banks. Dette var før Banks blev besejret ved Winchester. Frémont fik ordre til at flytte sine styrker mod HarrisonburgVirginia, mod sydøst. McDowell fik ordre til at sende 20.000 af sine 40.000 tropper for at støtte Banks ved Winchester.
Den 8. juni fandt Frémonts 11.500 mand store EU-hær Ewells konfødererede division ved Cross Keys i Virginia. Ewell havde fået ordre til at blokere Frémonts bevægelser mod Port Republic, Virginia. Slaget startede med en to timers duel mellem Unionens og Konføderationens artillerier. En flankemanøvre fra Unionens venstre side blev kastet tilbage af konfødereret volleyild. Den overraskende salve forårsagede 258 Unionens tab på knap ti minutter. Frémont var ikke klar over, at han havde at gøre med en mindre konfødereret styrke. Under beskyttelse af sine artilleribatterier trak Frémont sig tilbage til Keezletown Road. Den følgende dag, mens to konfødererede brigader holdt Frémont fast hvor han var, rykkede resten af Ewells konfødererede styrker mod Port Republic.
Slaget ved Port Republic
Den 9. juni 1862 blev det sidste af de seks slag i Jacksons Valley Campaign udkæmpet ved Port Republic i Virginia. Jackson var ankommet til området efter mørkets frembrud den 7. juni. Den næste dag fik han at vide, at Frémonts unionsstyrker var blevet forhindret i at slutte sig til general James Shields' styrker ved Cross Keys. Tidligt om morgenen den 9. juni brugte Jacksons styrker en provisorisk bro til at krydse over South River i Virginia. Unionsgeneral Erastus B. Tyler placerede artilleribatterier på en højderyg, der dækkede forsiden af Unionens stilling. Da Jackson ankom, beordrede han et angreb over hvedemarken uden at tage sig tid til at organisere sine styrker. Han havde heller ikke foretaget en rekognoscering for at finde ud af, hvilke unionsstyrker der var der, og hvordan de var placeret. Stonewall Brigade førte det konfødererede angreb an. Da de rykkede fremad, kom de under voldsomme angreb fra Tylers artilleribatterier. Jackson sendte Richard Taylors Louisiana brigade på et flankeangreb mod Unionens artilleri. Men Unionens artillerister så flankeangrebet udvikle sig og fastlåste de konfødererede med artilleriild. Jackson vidste, at han var nødt til at bryde igennem unionslinjen, før Frémont kunne slutte sig til Shields. Mens Jackson forsøgte at finde en måde at løse problemet på, ankom Ewells mænd fra Cross Keys. Ewell så straks problemet og han angreb Unionens venstre flanke. Dette gav Stonewall Brigade tid til at omgruppere. Konføderationens artilleribatterier åbnede op mod Unionens front. Dette fik Unionens linje til at bryde og falde tilbage på tilbagetog. Denne sidste sejr gav Jackson kontrol over den øvre og midterste del af Shenandoah-dalen.
