Lyntyven
Annabeth optræder første gang i Lyntyven og er tolv år gammel. Hun fik tilnavnet "Kloge pige" af Clarisse i et skænderi af fornærmelser. Navnet var ment som en fornærmelse, men nu er det et kærligt kælenavn.
Hun møder Percy Jackson første gang, efter at han er blevet angrebet af Minotaurus og har fundet vej til Half-Blood Hill. Da han så hende første gang, beskrev Percy Annabeth som "smuk" med blondt hår, der var krøllet "som en prinsesse". Efter Percy er blevet helbredt efter Minotaurus-angrebet, hører Annabeth, at han skal ud på en søgen, og hun vil gerne med, da hun tror, at Percy er "den eneste ene" fra Den Store Profetiale. Sammen går hun, Percy og Grover på jagt efter Zeus' stjålne lynnedslag. Gennem hele bogen viser Annabeth sin unikke intelligens, som hun har arvet fra sin mor, og også sin arachnofobi (frygt for edderkopper), som hun deler med alle sine søskende på moderens side (stammer fra historien om Arachne og Athena)
Havet af monstre
Annabeth, Percy og Tyson, der ikke har fået lov til at tage på jagt efter det gyldne skind for at redde Thalias fyrretræ og finde Grover ved hjælp af Chirons midlertidige afløser, sniger sig ud af Camp Half-Blood for at gøre det. I løbet af bogen afsløres det, at Annabeths største drøm er at omskabe hele verden for at forbedre den, redde Luke (fra sig selv) og blive accepteret af sin mor og far. Efter at være strandet på dronning-heksen Circes ø redder Annabeth Percy, efter at han er blevet forvandlet til en marsvin ved hjælp af de multivitaminer, som Hermes har givet dem. Under kampen med Polyphemus lader Annabeth (mens hun er usynlig ved hjælp af sin Yankee's Cap) som om hun er Nobody og distraherer ham længe nok til, at Percy kan besejre ham. Annabeth bliver dødeligt såret under kampen, men bliver helbredt ved hjælp af det gyldne skind.
Titanens forbandelse
Annabeth bliver kidnappet sammen med gudinden Artemis og må reddes af Percy, Thalia, Grover og jægerne Zoë Nightshade og Bianca di Angelo. I en drøm, som Percy har, befinder Annabeth sig på et bjerg, og hun ser Luke holde et sort tag op (Percy ved ikke, at det er himlen). Annabeth hjælper ham med at holde det, og så glider Luke ud under ham og får Annabeth til at holde det. Dette bliver senere brugt til at narre Artemis til at holde himlen, da Artemis ikke ville kunne modstå at hjælpe en jomfru. I modsætning til de andre bøger er Annabeths rolle ret lille. Det antydes i denne bog, at der vil være en romantisk fremtid for hende og Percy. Afrodite, kærlighedsgudinden, overbeviste også Percy om hans følelser for Annabeth, selv om hun også gjorde det endnu sværere for dem at blive forelskede. Til sidst redder Percy både Annabeth og Artemis, mens Thalia kæmper mod Luke, indtil han falder ned fra en klippe.
Kampen om labyrinten
I denne bog er Annabeth fjorten år gammel. Percy og Annabeth finder en indgang til Labyrinten. Hun indser, at Luke måske vil forsøge at bruge denne indgang til at invadere Camp.
Annabeth leder søgen ind i Labyrinten og opfylder dermed en af sine ambitioner. Hun går ind i Labyrinten sammen med Percy, Grover og Tyson for at finde en måde at forhindre Kronos' onde kræfter i at trænge ind i Camp Half-Blood ved at lede efter Labyrintens opfinder, Daedalus. Profetien, som Oraklet gav hende, synes at have skræmt hende, og hun nægter at sige den sidste linje. Da de går ind i Labyrinten, møder de mange prøvelser. Annabeth står over for en sfinx og finder gåderne (som faktisk er faktuelle spørgsmål) ikke udfordrende og en fornærmelse mod hendes intellekt. De undslipper sfinksens kløer og fortsætter for at finde Hefaistos, så han kan fortælle dem, hvor de kan finde Daedalus.
Da de begiver sig mod Hephaestus' smedje på Mount St. Helens, finder de telekhines der, hvor de laver et våben til Kronos. Percy siger til Annabeth, at hun skal flygte, mens hun kan. Hun kysser ham for held og lykke, og de går fra hinanden. Annabeth tror, at han dør, da Mount St. Helens går i udbrud, men det er ikke tilfældet. Percy falder ned på øen Ogygia, som er nymfen Calypsos, en datter af Atlas, fængsel. Da Percy kommer tilbage til lejren, er Annabeth i gang med at udføre et begravelsesritual for ham. Da hun opdager ham, omfavner hun ham og laver en scene. Men da hun finder ud af det med Calypso, bliver hun meget jaloux. Percy beder derefter en dødelig pige, Rachel Elizabeth Dare, om at hjælpe dem på deres vej gennem Labyrinten (Rachel har en sjælden evne til at se gennem tågen). Annabeth bliver meget jaloux over, hvor tæt Percy og Rachel kommer hinanden nær. De tre opdager Luke, som er blevet Kronos' fartøj. Efter en kamp bliver Luke tvunget tilbage i Labyrinten, og der er to tabte. Annabeth nægter at tro på, at Luke er helt ond, og bliver ret vred på Percy, fordi han siger noget andet.
Efter at de har fuldført deres mission, står Annabeth og Percy på Half-Blood Hill og matcher deres mål med profetien.Annabeth afslører den sidste linje i sin profeti: "At miste en kærlighed til værre end døden" og er forvirret, ikke sikker på om hun har følelser for Luke eller en hemmelig kærlighed til Percy. Til sidst tager hun af sted med sin far for at gå på en privatskole i San Francisco.
Den sidste olympier
I den sidste bog optræder Annabeth første gang, da Percy vender tilbage efter at have sprængt Kronos' skib, Prinsesse Andromeda, i luften. Efter hans ankomst hjælper Annabeth Percy med at høre den store profeti. Percy bader i floden Styx (han undslipper med nød og næppe ved at forestille sig, at Annabeth trækker ham op af floden) og ringer til Annabeth og fortæller hende, at hun skal møde ham foran Empire State Building sammen med alle halvguderne fra Camp Half Blood. Da Annabeth og Percy tager til Olympen, møder de Hermes, som Annabeth forsøger at undskylde over for, at Luke blev forvandlet til Kronos. Hermes bliver vred på hende og bebrejder hende, at hun ikke reddede Luke. Hermes går, og de vender tilbage til de andre campister for at forsvare Manhattan og Olympus. I kamp forsøger Ethan Nakamura at stikke Percy i den lille del af ryggen, hans akillespunkt, og Annabeth springer foran ham og tager kniven. Efter et par timers hvile går Annabeth tilbage i kamp, selv om hun stadig er svag efter giften. Kronos tager til Olympen, og Grover, Thalia, Percy og Annabeth følger ham. Kronos angriber Percy, og Annabeth slutter sig til kampen, men bliver slået ud af kampen, da Kronos smækker hende ind i Athenas trone. Til sidst redder hun Percy og Olympus ved endelig at indse profetiens sande betydning. Hun overtaler Percy til at give Luke sin kniv (som hun fik af Luke, da hun var syv år), så han kan stikke sig selv, dræbe sig selv og forvise Kronos til Tartaros endnu en gang. Hun bliver belønnet af guderne, som giver hende lov til at bruge sine talenter som arkitekt til at genopbygge Olympen. Percy Jackson nægter udødelighed på grund af sine følelser for Annabeth. På Camp Half-Blood i spisesalen senere samme dag kysser Annabeth Percy, efter at han har indrømmet sine følelser for hende. Hun advarer ham om, at hun aldrig vil gøre det let for ham. Herefter kysser de hinanden under vandet, efter at lytterne har smidt dem i kanosøen.