Cheminformatik
Cheminformatik (også kendt som kemoinformatik og kemisk informatik) er studiet af store mængder kemisk information. Det sker for det meste ved hjælp af computere. Disse værktøjer anvendes af medicinalvirksomheder til at finde nye lægemidler.
Cheminformatik bruger computervidenskab og informationsteknologi til at løse kemiske problemer. Cheminformatik beskæftiger sig med algoritmer, databaser og informationssystemer, webteknologier, kunstig intelligens og soft computing, informations- og beregningsteori, softwareudvikling, datamining, billedbehandling, modellering og simulering, signalbehandling, diskret matematik, kontrol- og systemteori, kredsløbsteori og statistik med henblik på at skabe ny viden om kemi.
Historie
Udtrykket kemoinformatik blev defineret af F.K. Brown i 1998:
Grundlæggende oplysninger
Cheminformatik kombinerer de videnskabelige arbejdsområder kemi og datalogi. Cheminformatik kan også anvendes til dataanalyse inden for papir-, papirmasse- og farvestofindustrien.
Bruger
Opbevaring og genfinding
Den primære anvendelse af cheminformatik er lagring af oplysninger om forbindelser. Den effektive søgning efter sådanne lagrede oplysninger omfatter emner, der behandles inden for datalogi som data mining og maskinlæring.
Filformater
Computere repræsenterer kemiske strukturer i specialiserede formater som f.eks. det XML-baserede Chemical Markup Language eller SMILES. Mens nogle formater er velegnede til visuelle repræsentationer i 2 eller 3 dimensioner, er andre mere velegnede til undersøgelse af fysiske interaktioner, modellering og docking-undersøgelser.
Virtuelle biblioteker
Kemiske data kan vedrøre reelle eller virtuelle molekyler. Virtuelle forbindelser kan bruges til at udforske det kemiske rum og forudsige nye forbindelser med de ønskede egenskaber.
Virtuelle biblioteker af klasser af forbindelser (lægemidler, naturprodukter, mangfoldighedsorienterede syntetiske produkter) blev for nylig genereret ved hjælp af FOG-algoritmen (fragmentoptimeret vækst).
Virtuel screening
I stedet for at afprøve de faktiske kemikalier indebærer virtuel screening en computerscreening af stoffer for at identificere stoffer, der sandsynligvis har de ønskede egenskaber, f.eks. biologisk aktivitet mod et givet mål.
Kvantitativt struktur-aktivitetsforhold (QSAR)
Dette er at forudsige stoffernes aktivitet ud fra deres struktur. Disse undersøgelser forbinder keminofrmatik med kemometri. Kemiske ekspertsystemer er også relevante. De repræsenterer dele af den kemiske viden i computere.
Spørgsmål og svar
Spørgsmål: Hvad er kemoinformatik?
Svar: Kemoinformatik er studiet af store mængder kemisk information ved hjælp af computere.
Spørgsmål: Hvilke værktøjer anvendes primært inden for kemoinformatik?
A: De værktøjer, der anvendes i kemoinformatik, er computere.
Sp: Hvorfor er kemoinformatik vigtig?
A: Kemoinformatik er vigtig, fordi den bruges af medicinalfirmaer til at finde nye lægemidler og til at løse kemiske problemer.
Sp: Hvad beskæftiger kemoinformatik sig med?
A: Kemoinformatik beskæftiger sig med algoritmer, databaser og informationssystemer, webteknologier, kunstig intelligens og soft computing, informations- og beregningsteori, softwareudvikling, datamining, billedbehandling, modellering og simulering, signalbehandling, diskret matematik, kontrol- og systemteori, kredsløbsteori og statistik.
Spørgsmål: Hvordan skaber kemoinformatik ny viden om kemi?
A: Kemoinformatik skaber ny viden om kemi ved at bruge computervidenskab og informationsteknologi til at analysere kemiske data og løse kemirelaterede problemer.
Spørgsmål: Hvad er kemoinformatik?
Svar: Cheminformatik er et andet navn for kemoinformatik.
Spørgsmål: Hvordan bruges kemoinformatik til at finde nye lægemidler?
A: Kemoinformatik bruges af medicinalvirksomheder til at analysere store mængder kemiske data og identificere mønstre, der kan bruges til at designe nye lægemidler.
