Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii er en endosymbiotisk gamma-proteobakterie. Den har det mindste kendte genom af alle bakterier.
Arten er en endosymbiont, der findes i alle arter af phloem-saftædende insekter, der er kendt som psyllider. Endosymbionten findes i en specialiseret struktur, der kaldes bakteriomet.
I 2006 blev genomet af en stamme af Ca. C. ruddi blev sekventeret på RIKEN i Japan og på University of Arizona. Genomet er et cirkulært kromosom på 159 662 basepar og har en høj kodningstæthed (97 %) med mange overlappende gener og en reduceret genlængde. Antallet af forudsagte gener var 182, hvilket også er det laveste antal gener, der nogensinde er registreret (NCBI-Genome). Talrige gener, der anses for livsvigtige, synes at mangle, hvilket tyder på, at arten måske har opnået organellignende status.
Til sammenligning har Mycoplasma genitalium, som har det mindste genom af alle fritlevende organismer, et genom på 521 gener.
Spørgsmål og svar
Spørgsmål: Hvad er Candidatus Carsonella ruddii?
A: Candidatus Carsonella ruddii er en endosymbiotisk gammaproteobakterie, der findes i alle arter af phloem-saftædende insekter kaldet psyllider.
Sp: Hvad er størrelsen af genomet hos Candidatus Carsonella ruddii?
Svar: Candidatus Carsonella ruddii's genom er det mindste kendte genom af alle bakterier og er et cirkulært kromosom på 159 662 basepar.
Sp: Hvor mange gener forventes at være til stede i Candidatus Carsonella ruddii?
Svar: Antallet af forudsagte gener i Candidatus Carsonella ruddii er 182, hvilket er det laveste antal gener, der er registreret (NCBI-Genome).
Sp: Hvad er den kodningsmæssige tæthed i genomet hos Candidatus Carsonella ruddii?
Svar: Candidatus Carsonella ruddii's genom har en høj kodningstæthed på 97 %.
Spørgsmål: Hvad er bakteriomet?
Svar: Bakteriomet er en specialiseret struktur, hvor endosymbionterne forekommer i Candidatus Carsonella ruddii.
Spørgsmål: Hvad mangler i Candidatus Carsonella ruddiis genom?
Svar: Mange gener, der anses for at være livsvigtige, synes at mangle i Candidatus Carsonella ruddiis genom, hvilket tyder på, at arten kan have opnået organellignende status.
Spørgsmål: Hvordan er Candidatus Carsonella ruddii's genom sammenlignet med Mycoplasma genitalium's genom?
A: Mycoplasma genitaliums genom, som har det mindste genom af alle fritlevende organismer, har 521 gener, hvilket er betydeligt højere end antallet af forudsagte gener i Candidatus Carsonella ruddii.
