Thomas Hooker (5. juli 1586 - 7. juli 1647) var en puritansk leder i kolonien. Han var kendt som en dygtig taler og som fortaler for en bredere kristne valgret end den, der ofte blev praktiseret i dele af Massachusetts. I 1633 emigrerede Hooker til New England med sin menighed og blev senere den første præst i Cambridge, Massachusetts, hvor han hurtigt fik betydelig indflydelse som åndelig leder og lærer.
Efter uenighed med nogle ledere i Massachusetts ledede Hooker i 1636 en gruppe bosættere mod vest og slog sig ned i området omkring nutidens Hartford. Her var han med til at grundlægge kolonien Connecticut og bidrog væsentligt til dens tidlige organisation og samfundsliv. Hooker spillede en central rolle i den tidlige udvikling af det koloniale New England og regnes i dag som én af de vigtigste grundlæggere i området.
Hookers teologiske og politiske synspunkter lagde vægt på menighedens og individets samvittighed samt på, at civil styreform bør hvile på folks frivillige samtykke. Mange historikere mener, at han var en vigtig inspirationskilde til "Fundamental Orders of Connecticut" fra 1639, som ofte omtales som et af de tidligste eksempler på en skriftlig konstitution i de engelske kolonier. Hans ideer påvirkede senere udviklingen af lokal selvstyre og demokratiske principper i kolonierne.
Hooker fik tilnavnet "Connecticuts fader". Som en af de mest respekterede prædikanter i sin tid holdt han mange prædikener og skrev om religiøse og kirkelige emner. Hans vægt på ordentlig kirkeorden, pædagogik og åndelig dannelse gjorde ham indflydelsesrig blandt puritanerne og i de nye samfund, han var med til at etablere.
Thomas Hooker døde den 7. juli 1647 i Hartford. Hans arv lever videre i de menigheder og byer, han var med til at skabe, og i de politiske og religiøse idéer, som var med til at forme det tidlige New England og senere amerikansk politisk tænkning.